More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1295 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  94.14 
 
 		 222 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 219 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 219 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 219 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  77.25 
 
 		 233 aa  338  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  61.17 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  54.64 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  47.09 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  49.46 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  46.23 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 208 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  45.23 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  45.08 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  45.08 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  42.49 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.01 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  44.21 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 187 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  35.75 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 		 173 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4828  transcriptional regulator, XRE family  36.81 
 
 		 173 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0464638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  36.42 
 
 		 173 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 190 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 173 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  30.64 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.83 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.86 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  31.74 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  32.24 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>