More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0316 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  97.83 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  95.65 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  86.96 
 
 		 184 aa  340  7e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  70.65 
 
 		 184 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  66.3 
 
 		 184 aa  272  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 182 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  62.5 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  54.89 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  41.9 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.93 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  39.89 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  38.8 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  36.51 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  35.48 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  29.02 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  31.62 
 
 		 503 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  25.67 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  26.49 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  28.02 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  25.56 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  22.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  25.44 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  25.44 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  24.16 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>