69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 355 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6378  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  36.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.99 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 374 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8538  transcriptional regulator, XRE family  28.32 
 
 		 321 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000674281  hitchhiker  0.0000867328 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 395 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  25.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  30.38 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4548  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  37.93 
 
 		 484 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  35.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  35.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  35.59 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 126 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 		 176 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  28.24 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 261 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  24.32 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.49 
 
 		 129 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 86 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>