21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4600 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4600  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  43.95 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4162  hypothetical protein  38.65 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0787626  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4548  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  45.53 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6378  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  36.44 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  28.05 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 85 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  31.78 
 
 		 513 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  26.27 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  29.58 
 
 		 119 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  34.62 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>