More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4331 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  38.1 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  43.28 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  46.55 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  45.45 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  45.45 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.61 
 
 		 377 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.11 
 
 		 377 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.6 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  42.11 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.88 
 
 		 376 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 333 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 98 aa  47.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  37.88 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 491 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  42.11 
 
 		 377 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.62 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2282  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>