More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1256 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 491 aa  999    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.75 
 
 		 388 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.26 
 
 		 391 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  62.5 
 
 		 388 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  61.22 
 
 		 395 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  61.03 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  63.24 
 
 		 389 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  61.03 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.52 
 
 		 389 aa  514  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.24 
 
 		 388 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.25 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  61.27 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.01 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  61.31 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  59.8 
 
 		 388 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.29 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  60.05 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  60.05 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  60.05 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.82 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.82 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.07 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  58.84 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.82 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  58.82 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.54 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  58.58 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  58.82 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 		 388 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.27 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  59.8 
 
 		 388 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.8 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 		 388 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  59.56 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  59.56 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.48 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  58.58 
 
 		 387 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  59.8 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.58 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.53 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.61 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  58.33 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.74 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.74 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.6 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.93 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  56.69 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  57.6 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.96 
 
 		 409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  56.34 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.1 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.13 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  48.06 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.64 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.8 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  28.4 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  30.03 
 
 		 453 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.72 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.11 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.28 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  29.65 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  29.65 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.68 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.89 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  29.46 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.81 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  28.8 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  28.95 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.98 
 
 		 436 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  27.42 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  29.92 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  30.38 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  28.95 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  29.09 
 
 		 450 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  30.65 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  27.25 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  29.07 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.15 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  27.51 
 
 		 470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  28.08 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.65 
 
 		 426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.32 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  29.1 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3605  nucleotide sugar dehydrogenase  29.87 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  30.91 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.23 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  28.87 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  26.72 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  28.69 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.65 
 
 		 450 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  28.39 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  28.34 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.23 
 
 		 451 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.14 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>