More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2039 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.87 
 
 		 188 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  55.61 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  53.59 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  51.6 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  47.09 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  46.93 
 
 		 194 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  45.86 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  44 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  44.63 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  44.63 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  44.63 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  44.63 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  44.63 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  43.82 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  45.3 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  46.39 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  40.54 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  44.75 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  42.13 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  43.5 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  41.21 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  39.43 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  35.39 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  29.65 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  37.59 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  27.17 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  31.07 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.07 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  25.9 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>