More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4768 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  376  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  80.42 
 
 		 193 aa  304  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  57.45 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  56.59 
 
 		 195 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  56.08 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  54.79 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  57.54 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  56.98 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  56.98 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  56.98 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  56.98 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  56.42 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  56.42 
 
 		 195 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  49.19 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  48.68 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  48.21 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  49.17 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  48.37 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  51.46 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  48.07 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.51 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 198 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  46.37 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  41.53 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  41.99 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  41.62 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.22 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  29.94 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  29.94 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  30.85 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  27.37 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  28.24 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  28.49 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>