More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3403 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  85.25 
 
 		 183 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  57.87 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  42.54 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  42.16 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  43.17 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  44.75 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.71 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  43.41 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  41.11 
 
 		 194 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 195 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  37.16 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  36.61 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  39.89 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  28.02 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  29.12 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  29.12 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.87 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  26.38 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.79 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  43.37 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  25.77 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>