More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0668 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  95.63 
 
 		 221 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  93.66 
 
 		 206 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  87.86 
 
 		 219 aa  361  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  87.86 
 
 		 219 aa  360  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  79.51 
 
 		 209 aa  321  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  64.71 
 
 		 192 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  62.92 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  62.36 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  62.36 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  62.36 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  62.36 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  58.76 
 
 		 194 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  61.45 
 
 		 195 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  61.8 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  56.54 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  59.56 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  60.12 
 
 		 193 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  45.05 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  45.65 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.38 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  43.26 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  42.93 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  38.42 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  37.57 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  36.68 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  36.81 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  35.45 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.24 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  26.5 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  27.42 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  26 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  32.62 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  29.57 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30.17 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  35.17 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  28.57 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>