More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1414 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
179 aa  360  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  46.77 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.62 
 
 
72 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
71 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
71 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  38.36 
 
 
488 aa  54.3  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.34 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  35.48 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 
77 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
71 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
88 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  33.87 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
334 aa  52  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 
188 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
230 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  37.68 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
83 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
120 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
72 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
96 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
76 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
84 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  35.94 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  34.18 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32.39 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
72 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
72 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  35.48 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  35.48 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
78 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
67 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
76 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
117 aa  48.9  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 
380 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  36.23 
 
 
230 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  39.06 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.79 
 
 
80 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
84 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
178 aa  48.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 
143 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
90 aa  47.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  38.81 
 
 
233 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.4 
 
 
203 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
90 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
180 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.87 
 
 
183 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.87 
 
 
183 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  33.87 
 
 
189 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
63 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
72 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 
204 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>