More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0207 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  40.62 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  41.43 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 490 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.39 
 
 		 481 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 490 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40.32 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.07 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 495 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 478 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  38.71 
 
 		 489 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 436 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1143 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 52 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 505 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  31.96 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 489 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  40 
 
 		 470 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 513 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>