269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0643 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  353  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  76.5 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 250 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 106 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  68.92 
 
 		 127 aa  97.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 110 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 103 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 122 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  49.58 
 
 		 119 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  64.2 
 
 		 119 aa  92  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  71.21 
 
 		 127 aa  91.3  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 104 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 104 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 104 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  68.66 
 
 		 115 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 150 aa  88.2  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 104 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  66.67 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  60.53 
 
 		 116 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  66.67 
 
 		 101 aa  84.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 119 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  56.63 
 
 		 91 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  65.15 
 
 		 135 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  61.33 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 116 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  59.72 
 
 		 89 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  65.28 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  63.89 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  65.28 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  65.22 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  65.28 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  63.89 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  48.41 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  60.49 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  59.42 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  66.15 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  57.69 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  62.03 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  54.55 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  64.2 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  55.56 
 
 		 101 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  59.72 
 
 		 101 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  60.94 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  56.41 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  60.38 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  49.32 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  71.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  55.74 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  35.54 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 99 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 145 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 115 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  34.31 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 		 128 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  47.37 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 130 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 325 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 72 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 505 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>