More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6629 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  283  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.59 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  39.2 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3170  putative phage-related transcriptional regulator  37.1 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0151351  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2943  putative phage-related transcriptional regulator  36.29 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  34.23 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  35.79 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 528 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  36.84 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6164  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 490 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0556  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4071  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  41.1 
 
 		 382 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.51 
 
 		 305 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 230 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 252 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 374 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  33.93 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  29.33 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  36.76 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  44.23 
 
 		 476 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 410 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.76 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  44.44 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.71 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 524 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  44.44 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  44.44 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  44.44 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.51 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  47.83 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  39.06 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2870  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  36.36 
 
 		 652 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>