190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3127 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  93.05 
 
 		 374 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  100 
 
 		 374 aa  772    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  96.26 
 
 		 374 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  98.4 
 
 		 374 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  92.51 
 
 		 374 aa  721    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  100 
 
 		 374 aa  772    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  97.06 
 
 		 374 aa  753    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  97.33 
 
 		 374 aa  753    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  89.26 
 
 		 242 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  49.05 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  36.34 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  23.36 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  26.42 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.86 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  30.86 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 142 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  39.68 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 142 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.26 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.16 
 
 		 149 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.16 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 149 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 92 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.16 
 
 		 149 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.72 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.74 
 
 		 262 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  39.74 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 186 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  48.08 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.96 
 
 		 206 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 192 aa  53.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 135 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  35.94 
 
 		 144 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  52.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 134 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 198 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 133 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 95 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 125 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 147 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 104 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 273 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 132 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 67 aa  50.4  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 334 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 196 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 268 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 85 aa  49.7  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  32.47 
 
 		 114 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  31.15 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>