37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5021 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5522  hypothetical protein  88.36 
 
 		 157 aa  260  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.821481  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0375  hypothetical protein  52.89 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000571325  normal  0.258978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3229  transcriptional regulator, XRE family  46.1 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5860  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 374 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  37.04 
 
 		 374 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 368 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  41.3 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 370 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 348 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 276 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2304  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2300  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2296  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2292  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0513  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4444  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  46.34 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 369 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>