189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0150 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  39.38 
 
 
197 aa  131  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.7 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
189 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 
189 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  42.06 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  50.68 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  55.38 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  40.19 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  39.25 
 
 
149 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  39.25 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  39.25 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 
134 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.33 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.4 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  40.23 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
204 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  28.67 
 
 
262 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 
334 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 
368 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  27.82 
 
 
262 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
320 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  25.38 
 
 
312 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.91 
 
 
362 aa  62.4  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
262 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 
262 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.44 
 
 
459 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.47 
 
 
328 aa  60.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
322 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 
369 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  45.76 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.71 
 
 
374 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.71 
 
 
374 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.71 
 
 
374 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.71 
 
 
374 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
327 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
242 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 
358 aa  58.2  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
374 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.77 
 
 
114 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.77 
 
 
114 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 
395 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  34.29 
 
 
374 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  35.71 
 
 
374 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  43.55 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.29 
 
 
374 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
364 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
380 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  42.31 
 
 
374 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
85 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  45.61 
 
 
149 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 
115 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
135 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 
118 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1674  hypothetical protein  35.8 
 
 
133 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1657  hypothetical protein  35.8 
 
 
133 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
63 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1855  DNA-binding protein  35.8 
 
 
131 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.18378e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  30.16 
 
 
296 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.54 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
137 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
71 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  43.55 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  39.62 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
79 aa  48.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.32 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>