147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L9_0006 on replicon NC_007107
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.45 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  39.87 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  40.16 
 
 		 134 aa  86.3  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.6 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  50 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  43.94 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.02 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 334 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  43.94 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  37.66 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 374 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 459 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 380 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.14 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.98 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  38.98 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  37.29 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 394 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 374 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.67 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 374 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 374 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 368 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  32.29 
 
 		 114 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  32.26 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 118 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 369 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 364 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  38.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 361 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  40.38 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>