135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2628 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 364 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  63.89 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  27.86 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  24.33 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  23.36 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  24.14 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  23.36 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  23.78 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  24.18 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  26.29 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 242 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  51.72 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  22.52 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  29.59 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.59 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 143 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.71 
 
 		 149 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 132 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.21 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 149 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 95 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  35.37 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  45.45 
 
 		 144 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 262 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35.14 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  41.18 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  30.12 
 
 		 114 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  41.18 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  26.05 
 
 		 149 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 183 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 147 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 67 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.1 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 99 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 67 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 83 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  40 
 
 		 67 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 66 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  32.94 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 94 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 94 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 94 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>