116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7086 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  62.37 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  52.53 
 
 		 99 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  51.95 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  34.18 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  48.28 
 
 		 264 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  31.52 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  32.18 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 210 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  32.18 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.11 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  29.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  29.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.58 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.58 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 364 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 383 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.29 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  35.85 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  26.44 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 359 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 256 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 512 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.46 
 
 		 509 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  39.62 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  27.06 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>