210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1796 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  31.54 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  27.69 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  33.66 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.03 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  31.82 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 395 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.95 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.44 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.57 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 320 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 115 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  31.43 
 
 		 459 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 63 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  52  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 118 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 361 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 63 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  35 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  36.67 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  30.11 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  37.29 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 123 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 369 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 69 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 64 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 141 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.89 
 
 		 436 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 277 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 358 aa  48.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 108 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 108 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 364 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 67 aa  46.6  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>