More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3135 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  57.04 
 
 
135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 
205 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 
364 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  48.39 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
327 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
322 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  45.16 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  45.16 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.16 
 
 
328 aa  63.9  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.03 
 
 
206 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  50 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
334 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 
369 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
206 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  49.18 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  49.18 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
268 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  42.19 
 
 
210 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 
196 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  41.94 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  28.45 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
244 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  40 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  40 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  40 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
273 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  40 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
364 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 
374 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
200 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 
194 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  43.55 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  43.33 
 
 
259 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
296 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  38.71 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 
208 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
361 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  38.98 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  32.14 
 
 
358 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.67 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.92 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.1 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.29 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.29 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
208 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  37.29 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
206 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  34.58 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  32.39 
 
 
338 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 
395 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.32 
 
 
362 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  39.62 
 
 
374 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  39.62 
 
 
374 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  39.62 
 
 
374 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  39.62 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  39.62 
 
 
374 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
459 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  42.31 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  40.38 
 
 
374 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  39.06 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>