207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0916 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  52.86 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  44.29 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.59 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.59 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  44.44 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  42.42 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.47 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 364 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  41.27 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 262 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 262 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 262 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 244 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 312 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 369 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  29.52 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.7 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  28.45 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 370 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 322 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  37.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  37.5 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  39.06 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>