233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2878 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 322 aa  648    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  39.64 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  31.78 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0230  hypothetical protein  27.06 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00373466  hitchhiker  9.5849e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1922  hypothetical protein  27.17 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  29.43 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24900  hypothetical protein  25.34 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  28.68 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.44 
 
 		 149 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.44 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32.45 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  31.79 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  49.25 
 
 		 92 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  49.25 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  50.79 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 137 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  52.83 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  28.66 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  29.46 
 
 		 194 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  40.51 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 99 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  44.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.01 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 115 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 115 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 95 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.4 
 
 		 114 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.4 
 
 		 114 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.62 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  30.26 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  30.26 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.78 
 
 		 144 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 139 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 104 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 163 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 68 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  44.44 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  36.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1922  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 93 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 111 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 68 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>