87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2005 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 388 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  53.22 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  47.57 
 
 		 509 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  34.14 
 
 		 470 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  35.97 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.76 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 322 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 459 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  38.04 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  29.63 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 118 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.76 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 247 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 272 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  28.94 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 104 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 328 aa  46.2  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 71 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  24.29 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.86 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 92 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 196 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 80 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  41.1 
 
 		 105 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 242 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 163 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.38 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  31.88 
 
 		 579 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 181 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 189 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 152 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 65 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 117 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 133 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 248 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  34.25 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 214 aa  43.1  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 68 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 142 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>