52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1710 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 420 aa  826    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  37.61 
 
 		 526 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  32.46 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  35.06 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  26.87 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  28.31 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.37 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  25.48 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  26.62 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  29.7 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  28.12 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  27.85 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.9 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  22.26 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  23.38 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  26.81 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  25.09 
 
 		 452 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 74 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 74 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  27.93 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  35.94 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  22.16 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  33.04 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  25.39 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 163 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  26.16 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  32.24 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 73 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 178 aa  43.9  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 276 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  32.76 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 73 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  24.87 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 95 aa  43.1  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>