52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6883 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  32.28 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.41 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  30.56 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  29.55 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  27.45 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.93 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.84 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.69 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  30.12 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1067  hypothetical protein  30.84 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119168  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  26.65 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  26.3 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  23.87 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  32.07 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  29.54 
 
 		 579 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  32.35 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  27.82 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  26.56 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.33 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.37 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  27.6 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  30.06 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  24.89 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  27.5 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  24.51 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 		 268 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  30.16 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  31.78 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  30 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  24.05 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  25 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 463 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.04 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  26.48 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  26.67 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  25.28 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  25.48 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  24.89 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>