197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2127 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  60.54 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  54.14 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.02 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  39.54 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  44.15 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  43.09 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  43.62 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  44.15 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  35.52 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  41.49 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.46 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.47 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  42.33 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  33.07 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  32.41 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  30.47 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  31.99 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.74 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  34.42 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  31.32 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  42.96 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  29.18 
 
 		 310 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  37.36 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  34.8 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  31.29 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  34.22 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 296 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.43 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  33.16 
 
 		 217 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  35.68 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  36.56 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  30.58 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  29.77 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  35.39 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  32.24 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  28.37 
 
 		 303 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.46 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  31.09 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  40.8 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.51 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.22 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.1 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  33.51 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  35.32 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  30.4 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  35.48 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  30.98 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  28.68 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  31.38 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  29.25 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  27.82 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  30.27 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  34.46 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.92 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.93 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  31.18 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  26.87 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.84 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.58 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  25.49 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  29.6 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>