203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5040 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.02 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.72 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  32.23 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  31.62 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  31.12 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  31.23 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  30.47 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 281 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  27.64 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  33.48 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  28.26 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  29.7 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  27.54 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.06 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  29.46 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  25.77 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  28.09 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  31.18 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  28.94 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  31.54 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.24 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.74 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  28.06 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  34.22 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  29.84 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  27.03 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  27.21 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  27.54 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  29.32 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.04 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  29.89 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  24.36 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  25.74 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  27.7 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.3 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  26.22 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  28.21 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  26.26 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  27.55 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  28.28 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  27.17 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.01 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  26.88 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  28.96 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  25.82 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  27.51 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  28.41 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  27.9 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  26.81 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>