172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0264 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.32 
 
 		 267 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.15 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 274 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.43 
 
 		 274 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  33.79 
 
 		 270 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 272 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 268 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1128  hypothetical protein  41.11 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00280699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  33.78 
 
 		 300 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  34.48 
 
 		 303 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.85 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.83 
 
 		 299 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  33.79 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.41 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  26.75 
 
 		 285 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  34.03 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  34.13 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 292 aa  67.8  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 292 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 287 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  30.46 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  32.41 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  31.45 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 		 296 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  31.88 
 
 		 302 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29.33 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  32.64 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  28.19 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 276 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  31.79 
 
 		 281 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 770 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3779  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  30.87 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  29.71 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  30.61 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  30.61 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  28.15 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  28.48 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  29.45 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6457  putative transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0109923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.75 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  28.87 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 291 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  26.49 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  31.39 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  24.82 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  27.15 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  30.5 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.2 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.73 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  26.85 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 		 267 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.61 
 
 		 284 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  30.66 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  30.2 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  26.92 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  25.17 
 
 		 410 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 293 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.99 
 
 		 281 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 280 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  30.61 
 
 		 284 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 445 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  42.42 
 
 		 293 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 283 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>