83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4136 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  44.02 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  42.02 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2309  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.74 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  27.76 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  25.58 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  28.44 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  27.89 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  25.65 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.48 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  25.98 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.15 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.48 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  33.88 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.85 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  26.4 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  26.32 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  25.36 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.6 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  28.74 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  24.61 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  25.86 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  29.03 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  27.33 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  27.81 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1128  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00280699  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  30.82 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  23.77 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  31.73 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  25.56 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.08 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.5 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 348 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  25.57 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  25.2 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  25.13 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  26.12 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  24.4 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6457  putative transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0109923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  27.81 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  28.67 
 
 		 406 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  23.25 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  23.2 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  25.65 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  25.75 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  37.93 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  26.02 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  26.62 
 
 		 284 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 289 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>