189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2688 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
270 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  68.4 
 
 
269 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  60.89 
 
 
272 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.23 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.8 
 
 
274 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
277 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.46 
 
 
269 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  34.77 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  34.98 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  34.22 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
268 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 
272 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  30.15 
 
 
270 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
267 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  30.42 
 
 
265 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  33.73 
 
 
269 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
268 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 
262 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 
271 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.06 
 
 
267 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  33.98 
 
 
254 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  31.48 
 
 
283 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 
287 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  32.16 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  37.08 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  31.76 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.25 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  33.74 
 
 
252 aa  92  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 
279 aa  92  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 
288 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  32.78 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  29.3 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.55 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 
285 aa  89  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  36.53 
 
 
212 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  39.49 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  28.17 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  31.29 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
292 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  28.72 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.18 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  39.35 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  35.78 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.2 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  38.81 
 
 
164 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  24.54 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  27.76 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  31.89 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  28.03 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  34.63 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.9 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  27.53 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  32.91 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  31.17 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.14 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  27.64 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  26.91 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  29.11 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.47 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  27.93 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  26.9 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.41 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  26.09 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.18 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  30.8 
 
 
302 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  28.67 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.17 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  34.88 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>