195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1172 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  63.27 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  62.19 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  56.84 
 
 		 292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 288 aa  331  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  58.78 
 
 		 290 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  56.27 
 
 		 303 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  59.03 
 
 		 295 aa  322  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  60.85 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  58.57 
 
 		 288 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  55.82 
 
 		 301 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  56.43 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  55.48 
 
 		 288 aa  318  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  54.64 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  53.79 
 
 		 288 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  58.21 
 
 		 302 aa  314  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 292 aa  308  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  54.21 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  55.83 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  52.78 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  53.21 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  52.55 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  51.23 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  53.57 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  50.53 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  50.9 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  47.14 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  47.65 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  45.69 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  41.99 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  42.96 
 
 		 410 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  42.81 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  38.49 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  43.11 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  40.89 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  41.91 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  38.99 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.7 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 328 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  37.64 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.34 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.21 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  36.9 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 295 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  35.84 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.43 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  39.26 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.95 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  46.59 
 
 		 212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.45 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  37.4 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.98 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  38.46 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  35.59 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  42.39 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  35.98 
 
 		 262 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.04 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  34.24 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  32.87 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  31.56 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  34.6 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  32.36 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>