201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4236 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.23 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  39.54 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  39.69 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  38.59 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.4 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  38.58 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  40.21 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  42.41 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  39.15 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.47 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  31.68 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  33.6 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.65 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  32.33 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.94 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  38.46 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 301 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  37.22 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  35.43 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  35.53 
 
 		 212 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.4 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.63 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  41.01 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  30.83 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  36.31 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  29.23 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 410 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  28.63 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  28.88 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  27.9 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  37.43 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  28.85 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.52 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.48 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  27.74 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  27.99 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  38.22 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  27.9 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.52 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  40.13 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  31.27 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  27.78 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  33.21 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  27.51 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  29.3 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  22.71 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.36 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.87 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  33.64 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  33.54 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.45 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  27.54 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.75 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  30.47 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>