193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4245 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
288 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 
284 aa  175  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 
285 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  33.94 
 
 
283 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  35.15 
 
 
287 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 
291 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 
287 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  36.17 
 
 
303 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.93 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 
282 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
293 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  31.82 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.56 
 
 
292 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.32 
 
 
281 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.23 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
287 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  31.47 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.03 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  32.38 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  31.54 
 
 
283 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  30.45 
 
 
292 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  32.13 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 
296 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
286 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.04 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.72 
 
 
287 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  32.16 
 
 
288 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  32.48 
 
 
284 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  29.97 
 
 
328 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  31.52 
 
 
285 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 
278 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  30.45 
 
 
290 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 
285 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  35.41 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  33.57 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  31.12 
 
 
288 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  31.32 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.67 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  30.04 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  29.66 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.84 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 
295 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  30.55 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 
276 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  32.16 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  30.39 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.39 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  32.16 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  30.63 
 
 
278 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
278 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  30.4 
 
 
281 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  29.89 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.57 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  31.82 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  27.66 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.53 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  29.18 
 
 
302 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  31.23 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  31.39 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  32.4 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  27.14 
 
 
283 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  30.31 
 
 
284 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  36.9 
 
 
212 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 
280 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 
267 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  30.24 
 
 
287 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 
280 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  29.23 
 
 
255 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.82 
 
 
267 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 
297 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  34.22 
 
 
255 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  35.36 
 
 
255 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  30.04 
 
 
292 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>