192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4868 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  44.02 
 
 
268 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  45.21 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  43.23 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  53.19 
 
 
254 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 
265 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  49.47 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
268 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  45.5 
 
 
255 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  37.83 
 
 
277 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 
262 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  43.39 
 
 
255 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  31.6 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  34.6 
 
 
267 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
268 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  34.56 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  52.94 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  41.49 
 
 
252 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 
270 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  33.96 
 
 
291 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  38.05 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 
279 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.62 
 
 
267 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 
282 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  31.06 
 
 
274 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  30.74 
 
 
269 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 
282 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
291 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 
267 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 
287 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  35.47 
 
 
272 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  33.01 
 
 
285 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  32.44 
 
 
285 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
296 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 
293 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  33.21 
 
 
288 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.49 
 
 
267 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  31.84 
 
 
283 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 
288 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  35.02 
 
 
285 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 
289 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
293 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  32.54 
 
 
292 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 
286 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  37.22 
 
 
217 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  30.5 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  31.32 
 
 
295 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.97 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  35.41 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  31.7 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  31.88 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  32.08 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.77 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  34.27 
 
 
289 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  38.62 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
290 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  30.36 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  30.65 
 
 
270 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 
292 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  35.12 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  31.84 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  39.86 
 
 
164 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.88 
 
 
288 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.06 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.75 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.31 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.55 
 
 
281 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 
271 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 
269 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.45 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  30.05 
 
 
299 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  31.11 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  38.76 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.72 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  27.8 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29.37 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  30.82 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  40.8 
 
 
212 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  28.41 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  30.66 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  37.8 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>