173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2581 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  29.15 
 
 
283 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 
293 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.41 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 
291 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  28.52 
 
 
288 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.74 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  27.55 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  27.1 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  26.47 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.41 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  25.46 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  27.56 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  27.05 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  26.86 
 
 
262 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  27.21 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  26.2 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 
288 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  28.14 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  25.65 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  27.96 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  26.89 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  25.56 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  26.1 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 
288 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  27.35 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
301 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 
289 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  25.74 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 
276 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  27.41 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  25.19 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  23.9 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  24.09 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  27.9 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  24.72 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 
296 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  29.54 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  26.74 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  24.54 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  27.13 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  26.79 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  30.99 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  25.45 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.09 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.77 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.88 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  24.12 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  23.25 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  24.64 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  24.18 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.69 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  24.32 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.87 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  25.55 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  24.56 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  25.86 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.6 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  23.38 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  25.19 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  26.82 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  24.73 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  23.32 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  26.17 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  25.66 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0418  transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  26.75 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  25.74 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  25.33 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  25.36 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.32 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  24 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  24.09 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  27.46 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>