184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2542 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
269 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  68.4 
 
 
270 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  61.99 
 
 
272 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.26 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 
277 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.32 
 
 
267 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  35.55 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  32.12 
 
 
287 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  35.89 
 
 
254 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  29.1 
 
 
270 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.32 
 
 
267 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  32.3 
 
 
267 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.11 
 
 
284 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 
268 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  32.12 
 
 
268 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 
271 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  31.06 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 
270 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 
296 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  31.58 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.48 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  27.99 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  30.6 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  30.15 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  29.34 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  28.73 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.97 
 
 
269 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  30.89 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  35.06 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.92 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  33.7 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  28.62 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 
291 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  35.82 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  30.47 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  33.7 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  30.27 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  31.97 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  28.1 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  29.12 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  30.94 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.32 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  32.58 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  30.58 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  30.07 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.62 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  28.09 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  34.36 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  29.43 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  33.88 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  35.14 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  30.89 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  25.89 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  30.25 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.88 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  30.55 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  27.7 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  28.01 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  26.29 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  25.8 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  28.87 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  26.28 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.81 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.23 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>