198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1433 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  95.57 
 
 		 245 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  63.53 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  62.75 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  48.05 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  48.83 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  49.61 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.19 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3010  hypothetical protein  63.57 
 
 		 169 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  44.04 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  41.49 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  42.33 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  42.41 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  37.57 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.76 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  36.04 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  38.33 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  36.17 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  35.98 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 285 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  38.92 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  31.43 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.07 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.81 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 		 288 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.88 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  37.08 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  37.08 
 
 		 281 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  32.62 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  39.85 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.11 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  36.02 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  37.11 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  34.39 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  38.85 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  36.02 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  32.97 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.02 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  34.95 
 
 		 301 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  34.95 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  33.88 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  36.55 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  31.32 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.16 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  35.74 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.89 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  29.74 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.1 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  35 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  34.59 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0707  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  31.96 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  35.15 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.63 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  31.5 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  27.32 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  33.75 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.98 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  31.69 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  33.88 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  29.1 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>