151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3502 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  57.04 
 
 		 268 aa  160  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  37.32 
 
 		 255 aa  94.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 268 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  36.62 
 
 		 255 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.86 
 
 		 269 aa  90.5  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 265 aa  84.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  34.93 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.17 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 267 aa  77.8  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.37 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 268 aa  73.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  34.39 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  32.62 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  32.33 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  33.54 
 
 		 283 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.78 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  34.06 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 410 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.86 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  34.92 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  31.65 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 282 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.78 
 
 		 282 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.28 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  32.82 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  28.83 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  30.28 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  34.75 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  30.82 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  30.99 
 
 		 287 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  31.29 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  32.09 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.66 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.94 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0263  putative DNA-binding protein  31.86 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0707  hypothetical protein  31.16 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  32.21 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  31.01 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  30.3 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29.03 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  40.22 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  33.61 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  32.59 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 291 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.64 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2091  hypothetical protein  28.8 
 
 		 273 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  27.66 
 
 		 288 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  35.09 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  26.57 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  31.11 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  33.6 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>