190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1479 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  40.62 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  41.32 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6373  hypothetical protein  36.65 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  34.56 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  32.61 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  33.94 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.45 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 410 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  34.42 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  31.79 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  34.3 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  31.8 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.36 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.04 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  35.84 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.12 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.58 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.22 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  32.13 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  32.62 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  33.1 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  33.94 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.26 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  30.69 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  31.92 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  32.02 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  32.8 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  31.67 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.02 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  34.27 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  33.47 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.07 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.51 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  30.58 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  34.95 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  35.68 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  32.96 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  32.34 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.24 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  32.94 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  32.39 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.37 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  27.74 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  31.79 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  29.78 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  30.07 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  30.07 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  31.12 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.58 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.08 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  27.97 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  32.66 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  30.28 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>