191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2430 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  35.29 
 
 		 291 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  34.87 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  35.61 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  34.64 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  30.96 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  34.19 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.86 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  32.84 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  29.5 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  31.12 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  33.09 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.61 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  29.82 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  30.04 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  30.58 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  28.41 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  31.5 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  30.04 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  29.64 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  30.04 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  27.05 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.47 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  27.7 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.7 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  29.71 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  29.85 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.76 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  28.78 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.06 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  31.05 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  27.9 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  29.67 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  27.14 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  26.6 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.47 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  32.1 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  30.54 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.62 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  29.04 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  29.67 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  31.58 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  27.74 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  26.41 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  28.3 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.84 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.21 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  26.24 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  28.11 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  26.12 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  29.82 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  27.76 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  28.67 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  26.94 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  26.76 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  29.88 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>