231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2542 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
277 aa  563  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  41.67 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 
268 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.83 
 
 
269 aa  158  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 
265 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 
268 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.5 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.64 
 
 
270 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 
291 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
267 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 
270 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  36.96 
 
 
255 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  35.77 
 
 
262 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  40.21 
 
 
255 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 
272 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  36.58 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  42.33 
 
 
254 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.42 
 
 
267 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  34.89 
 
 
279 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  39.18 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
270 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  34.44 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  32.59 
 
 
268 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 
293 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 
269 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  32.59 
 
 
285 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
291 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 
288 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
293 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.6 
 
 
287 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 
288 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  35.95 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 
301 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 
285 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  31.65 
 
 
269 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  33.21 
 
 
308 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  30.4 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  34.07 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  31.12 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  38.59 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  34.22 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 
276 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  37.14 
 
 
212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  37.63 
 
 
295 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  31.32 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  30.29 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.41 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  31.77 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  30.29 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  32.7 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.7 
 
 
282 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  39.87 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 
288 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.89 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  36.87 
 
 
301 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  33.21 
 
 
299 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.95 
 
 
287 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 
272 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  31.69 
 
 
300 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  37.1 
 
 
295 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  31.27 
 
 
283 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  33.6 
 
 
294 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 
274 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 
280 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 
282 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  37.78 
 
 
252 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  31.23 
 
 
293 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 
271 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  47.01 
 
 
245 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 
278 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  30.69 
 
 
301 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 
285 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  35.42 
 
 
294 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.71 
 
 
285 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 
284 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.37 
 
 
279 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 
328 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 
282 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 
410 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.24 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.45 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  29.67 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  31.42 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>