199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0102 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  90.59 
 
 		 255 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  47.66 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  47.27 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  48.05 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  50.99 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  42.05 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  43.92 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  44.62 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.39 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  44.15 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  40.21 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  34.12 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3010  hypothetical protein  49.23 
 
 		 169 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  36.61 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  32.38 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.75 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  37.3 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.08 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  34.22 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  40.27 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.14 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  35.18 
 
 		 278 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  41.28 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.55 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.62 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.6 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  29.32 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  49.57 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.51 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  30.04 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  33.95 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  29.85 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.26 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  36.31 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  40.28 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.39 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  36.9 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.11 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  37.43 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 290 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  33.17 
 
 		 294 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  34.22 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.52 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.93 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  37.71 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  33.51 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  34.05 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  37.32 
 
 		 164 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  39.16 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  40.88 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  32.54 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 410 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  40.31 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  31.72 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  30.69 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.02 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  32.84 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  33.86 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  30.27 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  28.87 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>