190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1351 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  100 
 
 
299 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  36.24 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  37.97 
 
 
283 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  34.53 
 
 
285 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 
289 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
410 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  34.39 
 
 
288 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
292 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.56 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  34.08 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  35.42 
 
 
287 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 
293 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  34.22 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  34.47 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.92 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  34.2 
 
 
301 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
288 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  33.08 
 
 
282 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  34.32 
 
 
295 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 
282 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
291 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  35.65 
 
 
280 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  33.94 
 
 
288 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  33.79 
 
 
292 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  31.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  34.35 
 
 
278 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.37 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  44.72 
 
 
212 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  33.9 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 
287 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 
290 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  34.75 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 
291 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  30.3 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  31.47 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.12 
 
 
281 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  35.15 
 
 
280 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 
290 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  34.78 
 
 
287 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  34.5 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  32.61 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  35.55 
 
 
285 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  33.17 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  36.65 
 
 
319 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
287 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  32.27 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  34.15 
 
 
301 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  34.2 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 
328 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 
277 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 
281 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  30.42 
 
 
284 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.7 
 
 
283 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  38.14 
 
 
267 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  31.87 
 
 
310 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  32.27 
 
 
293 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.29 
 
 
278 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 
284 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 
282 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  33.83 
 
 
282 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  32.18 
 
 
299 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  32.57 
 
 
269 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 
288 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  31.73 
 
 
262 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 
270 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 
281 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5233  hypothetical protein  28.41 
 
 
272 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 
279 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  29.93 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.49 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  31.47 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.05 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  29.68 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  33.64 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  27.9 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  27.69 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  34.64 
 
 
276 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  31.35 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.1 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.27 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>