201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0907 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  48.44 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  45.67 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  43.06 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  44.6 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  45.58 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  47.78 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  45.04 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  41.32 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  43.8 
 
 		 290 aa  224  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  44.24 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.44 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  45.17 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  45.19 
 
 		 294 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  41.99 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  42.24 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  42.96 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  42.61 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  44.6 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  41.2 
 
 		 308 aa  208  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  40.79 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  41.64 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  41.64 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  40.85 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  39.85 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  41.38 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  39.22 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  45.07 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  43.07 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  39.64 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  41.52 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  44.81 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  39.16 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  41.87 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  37.28 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 284 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.89 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  38.68 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.44 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  35.55 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.22 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  37.18 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.86 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  35.61 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  39.18 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  37.46 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  37.89 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  36.65 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.71 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  34.01 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  32.99 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  39.27 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  38.16 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  34.72 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  34.83 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  38.55 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  32.64 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  32.03 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  32.49 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  32.29 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.96 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  37.41 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>