200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0875 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 292 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  69.82 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  67.61 
 
 		 288 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  65.72 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  64.29 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  67.97 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  63.14 
 
 		 303 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  66.9 
 
 		 295 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  64.62 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  62.46 
 
 		 301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 296 aa  348  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  56.84 
 
 		 296 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  61.01 
 
 		 288 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  62.37 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  59.21 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  60.89 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.3 
 
 		 292 aa  328  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  59.5 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  55.48 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  56.12 
 
 		 308 aa  312  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  57.14 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  57.64 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  56.41 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  52.88 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  50.71 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  50.18 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  53.24 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  52.69 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  47.04 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  47.99 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  43.43 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  44.4 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  47.41 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  44.24 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  42.32 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  40.27 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  41.46 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  42.44 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  42.98 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 410 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  41.15 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  37.91 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  44.08 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  44.08 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  41.92 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  39.57 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  38.35 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.84 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  38.18 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  32.21 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  38.58 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.1 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.54 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.01 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  41.04 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.37 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.16 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  38.72 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  35.83 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  39.38 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  43.82 
 
 		 212 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.4 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  38.65 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  35.38 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  34.93 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  33.2 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  37.16 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  32.03 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  34.09 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  34.72 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>