192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4158 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  52.84 
 
 		 289 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  49.14 
 
 		 291 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  49.15 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  48.59 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  44.69 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  46.11 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 		 410 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  44.69 
 
 		 285 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  43.5 
 
 		 288 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  43.45 
 
 		 293 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  45.81 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  46.59 
 
 		 296 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  46.02 
 
 		 288 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 		 287 aa  151  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  43.82 
 
 		 292 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  39.89 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  44.13 
 
 		 290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  39.88 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  45.35 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  45.45 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  46.02 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.62 
 
 		 292 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  44.89 
 
 		 303 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  39.2 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  42.46 
 
 		 287 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  43.43 
 
 		 303 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  45.81 
 
 		 295 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.77 
 
 		 284 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  46.02 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 291 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 291 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  43.2 
 
 		 282 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  41.34 
 
 		 280 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  42.86 
 
 		 274 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  41.9 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  44.13 
 
 		 295 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  41.24 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.26 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  43.18 
 
 		 302 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  41.48 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 283 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  40.59 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  42.95 
 
 		 294 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  41.34 
 
 		 270 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  38.29 
 
 		 301 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  44.72 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  36.02 
 
 		 296 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  40.91 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  40.45 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.68 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 284 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  37.71 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  39.31 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.89 
 
 		 286 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  39.62 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  33.9 
 
 		 291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 286 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 287 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 267 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  43.06 
 
 		 276 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  37.57 
 
 		 290 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  40.37 
 
 		 310 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  36.81 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.8 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  34.83 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.42 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  40.14 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  33.93 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  35.2 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>