179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2769 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.89 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.63 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  28.4 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  27.72 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  27.86 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  28.84 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  29.26 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  24.33 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  29.04 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 410 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  30.3 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.07 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  26.91 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  29.28 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  25.27 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  25.73 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  28.87 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  29.53 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  29.67 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  26.57 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  29.78 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  24.26 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.91 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.43 
 
 		 146 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  25.49 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  28.65 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.05 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  27.92 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  28.44 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2309  transcriptional regulator, XRE family  26.46 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  28.14 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  28.31 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  29.35 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  28.15 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.5 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  27.9 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  29.51 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  35.04 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  26.33 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  28.02 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  24.54 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  31.41 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3779  transcriptional regulator, XRE family  24.89 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  26.28 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.72 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  34.27 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  24.82 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.22 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  30.48 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  33.56 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  23.69 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  31.21 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  26.18 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26.86 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  26.06 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  30.47 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  26.41 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  27.08 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  34.26 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>