183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7764 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  44.2 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.66 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  38.33 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  37.43 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  34.42 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  43.57 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.22 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 284 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  36.11 
 
 		 255 aa  98.2  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.31 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  36.57 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 270 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  36.61 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  37.06 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  40.44 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  33.16 
 
 		 268 aa  95.9  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  41.91 
 
 		 285 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.24 
 
 		 279 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 285 aa  95.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  38.51 
 
 		 245 aa  94.7  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  42.97 
 
 		 294 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 293 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  45.83 
 
 		 288 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  44.62 
 
 		 294 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 291 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  38.64 
 
 		 303 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 290 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.23 
 
 		 284 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  37.04 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  32.77 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  45.19 
 
 		 295 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 288 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  40.34 
 
 		 280 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  34.25 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  35.07 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 292 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 279 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 285 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  44.76 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 		 288 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.09 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6457  putative transcriptional regulator, XRE family  74.51 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0109923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  35.59 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  37.78 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  41.91 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  38.19 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  30.6 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  32.6 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  34.29 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.48 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  36.69 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  33.78 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.04 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  34.55 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  38.35 
 
 		 410 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.56 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  40.56 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.56 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  35.92 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  34.1 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  36.88 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  35.07 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  33.07 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  39.84 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>